ابداع تکنیک هاي نوين جهت شناسایی مسیر تولید ترکیبات ثانویه يکي از چالش هاي محققین می باشد، زيرا بدون درک درست از مسیر سنتز متابولیت ها، رسیدن به اهدافي از جمله افزايش میزان متابولیت ها، تولید متابولیت هاي جديد، وگسترش مارکرهاي مولکولي بسیار دشوار، زمانبر و پرهزینه است.
در سال هاي اخیر فناوري زيستي با استفاده از روش هايي نظیر تجزيه وتحلیل ترنسکريپتوم به کمک تکنیک RNA-Seq قادر است کارايي گیاهان دارويي را در جهت تولید دارو افزايش دهد. شناسايي و دستورزي ژنتیکي آنزيم هاي دخیل در مسیر بیوسنتز متابولیت هاي ثانويه جهت افزايش میزان آن ها و تولید متابولیت هاي جديد ميتواند زمینه را براي کاربرد چنین تکنیک هايي در گیاهان دارويي نیز فراهم نمايد. همچنین شناسايي مسیرهاي موثر در تولید ترکیبات دارويي گیاهان و افزايش بیان ژن هاي هدف آن ها ميتواند بخش بزرگي از نیازهاي جامعه بشري در تولید داروهاي گیاهي رفع نمايد و سبب تامین سلامت جوامع بشري و افزايش پتانسیل اقتصادي در تولید گیاهان به عنوان يک منبع درآمد مطمئن را فراهم سازد.
تحقیق پیشرو نخستین مطالعه از ترنسکريپتوم از طريق RNA-seq پنج گونه آویشن مي باشد. آنالیز ترانسکریپتوم براي تفسیر عملکرد عناصر ژنومی و آشکارسازي اجزاء اصلی ملکولی سلول ها و بافت ها ضروري است. بر این اساس ارزیابی ترانسکریپتوم یک رویکرد مناسب براي بدست آوردن اطلاعاتی در زمینه سطوح عملکردي ژنومی براي موجودات می باشد. همچنین در شناسایی مارکرهای مولکولی جدید بر پایه ی ژن های بیان شونده برای اهداف اصلاحی نیز قابل استفاده می باشد.
اهداف
- شناسایی مسیر بیوسنتزی ترکیبات ترپنوئیدی در گونه های جنس آویشن
- شناسایی بخشی یا کل توالی ژن های کلیدی دخیل در سنتز تیمول وکارواکرول
- شناسایی و توسعه ی مارکرهای مولکولی جدید از قبیل ریز ماهواره ها با هدف ارزیابی و اصلاح در این جنس
-بررسی ارتباط فیلوژنتیکی میان گونه ها بر مبنای حجم وسیعی از اطلاعات ترنسکریپتوم